Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABEP1Q15276 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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