Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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