Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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