Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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