Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME4Q14997 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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