Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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