Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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CNGB1Q14028 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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CNGB1Q14028 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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CNGB1Q14028 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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CNGB1Q14028 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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