Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CDK13Q14004 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
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