Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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