Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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