Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOFQ13790 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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