Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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NAE1Q13564 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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NAE1Q13564 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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NAE1Q13564 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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NAE1Q13564 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms