Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPM6BQ13491 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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