Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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