Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLAMF1Q13291 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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