Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SEMA3BQ13214 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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