Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NR1H3Q13133 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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