Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms