Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACACAQ13085 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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