Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms