Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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