Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNIP3Q12983 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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