Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF2Q12933 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms