Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms