Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAPQ12770 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAPQ12770 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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