Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms