Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACSM1Q08AH1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms