Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms