Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPOCK1Q08629 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms