Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms