Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFF3Q07654 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms