Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSME1Q06323 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSME1Q06323 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms