Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms