Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN1Q05586 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms