Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCZQ05513 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.8 ms