Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms