Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms