Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms