Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms