Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms