Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC10Q01780 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC10Q01780 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms