Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms