Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTBN1Q01082 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms