Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKB2Q00653 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFKB2Q00653 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFKB2Q00653 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFKB2Q00653 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKB2Q00653 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms