Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms