Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM3AP98173 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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