Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms