Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms