Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF6P62330 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms