Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms